Из нарушений на едином государственном экзамене (ЕГЭ) чаще всего встречается публикация заданий или ответов на них в интернете. За это выпускников лишают аттестата, учителям и чиновникам грозит штраф до 5 тыс. руб. по ст. 13.14 КоАП РФ «Разглашение информации с ограниченным доступом». В 2012 году за такие нарушения Рособрнадзор аннулировал результаты 172 школьников. В 2013 году после серии скандалов вокруг ЕГЭ в отставку ушел глава Рособрнадзора Иван Муравьев.
С 2011 года на ЕГЭ запрещено приносить мобильные телефоны. Если это происходит, то работа признается недействительной. Также по ч. 4 ст. 19.30 КоАП «Нарушение требований к ведению образовательной деятельности и организации образовательного процесса» выпускникам грозит штраф от 3 тыс. до 5 тыс. руб. Для учителей, допустивших пронос телефона, предусмотрен штраф от 20 тыс. до 40 тыс. руб. Кроме того, за такие нарушения было уволено несколько преподавателей.
На ЕГЭ периодически выявляется подтасовка результатов экзаменов. В 2012 году в Омске суд признал виновным руководителя Регионального информационно-аналитического центра системы образования Виталия Федотова по ч. 1 ст. 286 УК РФ «Превышение должностных полномочий» и постановил уволить и отстранить чиновника от государственных постов на 3,5 года. Выяснилось, что он подменил бланки учеников бланками, заполненными учителями. В январе 2013 года Майкопский горсуд признал виновной по той же статье заместителя министра образования Адыгеи Марьят Алиеву и запретил ей занимать государственные посты в течение двух лет. Следствие установило, что Алиева передала детям готовые варианты ответов.
Встречаются случаи, когда за школьников сдают экзамен под их именем. Так, в 2011 году шесть студентов МФТИ сдавали ЕГЭ в школе №958 города Москвы под видом выпускников. Они были отчислены из вузов, но в том же году восстановлены. За скандалом последовал ряд увольнений. Постов лишились начальник Северо-Восточного окружного управления образования Москвы, главный специалист окружного управления, а также пять учителей. Директор школы ушла по собственному желанию.