Сейчас «Система» владеет долями в 16 компаниях. Ей через ЗАО «Система-Инвест» принадлежит 90,5% ОАО «Башкирская электросетевая компания» (БЭСК), выделенного в 2012 году при разделе «Башкирэнерго» между АФК и «Интер РАО» (выручка БЭСК по МСФО за 2013 год — 13,5 млрд руб., чистая прибыль — 3,4 млрд руб.). Компания владеет 50% в «СГ-Трансе» (парк — около 35 тыс. вагонов, выручка по МСФО в первом полугодии — 10,3 млрд руб., чистая прибыль — 314 млн руб., чистый долг — 23 млрд руб.). В октябре «СГ-Транс» заключил контракт на перевозку с «Башнефтью» на 65 млрд руб. до конца 2019 года. С бизнесом «Башнефти» связана и «Таргин», управляющая сервисными активами нефтекомпании, проданными в 2013 году.
Выручка МТС в третьем квартале 2014 года снизилась на 6,2%, до $2,9 млрд, чистая прибыль от МТС в доле АФК «Система» упала на 19% в годовом исчислении, до $234,6 млн. Выручка высокотехнологичного холдинга РТИ, который ориентирован на оборонную отрасль, сократилась в годовом исчислении на 8,8%, до $435,3 млн, а его чистый убыток в доле АФК составил $21,2 млн. Выручка медийного холдинга «Система Масс-медиа» в третьем квартале — $22,6 млн, что на 25,3% ниже результатов в 2013 году, чистая прибыль от него в доле АФК — $1,7 млн.
Активы АФК «Система» на потребительском рынке развиваются по-разному. Убытки в третьем квартале принес производитель лекарственных препаратов «Биннофарм» ($0,7 млн). Зато АФК смогла заработать на «Детском мире» $26,3 млн, сети клиник «Медси» — $9,9 млн, туристической компании «Интурист» — $2,2 млн. Как ранее сообщал “Ъ”, АФК «Система» планировала продать миноритарный пакет «Детского мира» Российско-китайскому инвестиционному фонду, однако после ареста Владимира Евтушенкова сделка была отложена.