Заметную активность в борьбе за права потребителей банковских услуг Роспотребнадзор начал проявлять с лета 2006 года. Тогда претензии о неправомерности взимания ряда дополнительных комиссий и штрафов с банковских розничных заемщиков, которые существенно увеличивали выплаты граждан по кредитам, были предъявлены лидерам рынка потребительского кредитования: ХКФ-банку и банку «Русский стандарт». К урегулированию ситуации с защитой прав граждан в этом сегменте не без участия Роспотребнадзора были привлечены Федеральная антимонопольная службы и прокуратура. Под таким давлением оба банка избавились от дополнительных комиссий. Но благодаря организованной Роспотребнадзором громкой «антикомиссионной кампании» решение этого вопроса стало актуальным для всего банковского рынка. И летом 2007 года Банк России обязал банки учитывать все дополнительные выплаты по кредитам в раскрываемой заемщику эффективной ставке. Впрочем, такое решение проблемы ведомству Геннадия Онищенко показалось недостаточным. Оно продолжило борьбу за незаконность дополнительных банковских комиссий в судах. И в ноябре 2009 года президиум ВАС, рассматривая спор Роспотребнадзора со Сбербанком, постановил, что взимание банками очень распространенных комиссий за открытие и ведение ссудного счета незаконно. Еще одним объектом пристального внимания Роспотребнадзора стали взаимоотношения банковских заемщиков и коллекторов. В конце 2007 года Роспотребнадзор направил в Генпрокуратуру жалобу на «специфические» методы работы коллекторов. В 2010 году он продолжил борьбу с практикой передачи им банковских долгов: ведомство заявило, что в соответствии с вступившим в силу 1 января 2010 года положением закона «О персональных данных» продажа долга коллектору возможна, только если у банка есть согласие заемщика на передачу данных о нем третьим лицам. Осенью 2011 года Высший арбитражный суд выпустил обзор судебной практики, построенной на спорах Роспотребнадзора с банками, где фактически признал незаконной передачу прав требований по кредиту банком организации, не имеющей банковской лицензии, без согласия должника. Впрочем, полной победы в борьбе с коллекторами Роспотребнадзор пока не одержал. Почти год спустя Верховный суд занял совершенно иную позицию.