4 ноября 2002 года Московский третейский суд принял решение расторгнуть совершенную в апреле 2001 года сделку о приобретении "Славнефтью" 92% акций "Варьеганнефти" (компания обеспечивала 9,5% нефтедобычи "Славнефти"). Акции "Варьеганнефти" вернулись в собственность пяти офшорных компаний, подконтрольных бывшему президенту "Славнефти" Михаилу Гуцериеву, после того как он вернул $290 млн, полученных ранее за бумаги.
14 февраля 2006 года в третейском суде РАО "ЕЭС России" началось разбирательство между РАО ЕЭС и ТОО "Богатырь Аксес Комир" ("дочка" Access Industries Леонарда Блаватника), арендовавшим у энергокомпании разрез Северный в Экибастузском угольном бассейне Казахстана. В иске "Богатыря" на 1,5 млрд руб. говорилось, что в период действия контракта на недропользование компания потратила на горно-подготовительные работы 1,7 млрд руб. и приобрела для РАО ЕЭС имущество более чем на 545 млн руб. В ноябре 2006 года стороны подписали мировое соглашение: в обмен на отзыв иска РАО ЕЭС обязалось отдать "Богатырю" в собственность разрезы компании.
В сентябре 2006 года Международный коммерческий арбитражный суд (МКАС) при Торгово-промышленной палате России удовлетворил иски люксембургской Yukos Capital S.a.r.l., подконтрольной экс-менеджерам ЮКОСа, о взыскании около $424 млн с "Роснефти" по долгам поглощенного "Юганскнефтегаза" (бывшей дочерней компании ЮКОСа). Российские арбитражи решение МКАС отменили, но 28 апреля 2009 года его признал апелляционный суд Амстердама, а 25 июня 2010 года — Верховный суд Нидерландов. Спустя три дня после этого сменился председатель МКАС — свой пост покинул Александр Комаров, возглавлявший его 17 лет, но в Торгово-промышленной палате связь этого решения с делом ЮКОСа отрицали. 9 августа того же года "Роснефть" сообщила, что выплатила Yukos Capital S.a.r.l. взыскиваемую сумму, в рублевом эквиваленте она составила 12,9 млрд руб.
В ноябре 2011 года третейский суд при ОАО "Газпром" удовлетворил иск "Газпрома" о взыскании с ОАО "Камчатгазпром" задолженности в размере 2,1 млрд руб. по договору займа. Деньги "Газпром" выдал "Камчатгазпрому" в марте 2008 года. Решение третейского суда добровольно выполнено не было. В феврале 2012 года "Газпром" обратился в арбитражный суд Камчатского края о признании и принудительном исполнении решения третейского суда, этот иск был удовлетворен. 25 июля 2012 года Федеральный арбитражный суд Дальневосточного округа в Хабаровске вслед за судом первой инстанции подтвердил решение третейского суда.