Родился 9 декабря 1950 в Ленинграде. Окончил гидротехнический факультет Ленинградского политехнического института. С 1974 — мастер, прораб, главный инженер, замначальника СМУ "КолымаГЭСстрой". С 1982 — на руководящих должностях на Колымской ГЭС. С 1989 — гендиректор "КолымаГЭСстроя", позже АО "Колымаэнерго", член совета директоров РАО "ЕЭС России". С 1994 — депутат, с 1997 — председатель Магаданской облдумы. В 1999 избран в ГД, руководил фракцией "Отечество — Вся Россия". "Новая газета" сообщала, что в 2001 он был фигурантом уголовного дела о хищении акций "Колымаэнерго", позже закрытого. В 2003, 2007 переизбирался в ГД. С 2003 — вице-спикер, с 2007 — первый заместитель главы фракции ЕР. Доктор технических наук (тема — "Научное обобщение технико-экономических решений по строительству каменно-земляных плотин в условиях Крайнего Севера"). Награжден орденами "За заслуги перед Отечеством" III и IV степеней, Почета, Дружбы. Заслуженный строитель РФ. Женат, сын.
Согласно данным из декларации за 2011 год, сумма годового дохода господина Пехтина составляет 2,15 млн руб., его супруги — 166,7 тыс. руб.
На господина Пехтина зарегистрировано шесть земельных участков под индивидуальное жилищное строительство в РФ общей площадью 9,7 тыс. кв. м, квартира площадью 182 кв. м, нежилое здание площадью 189,8 кв. м, земельный участок для размещения объектов транспорта площадью 1,9 тыс. кв. м.
На супругу господина Пехтина зарегистрированы дачный земельный участок площадью 12,7 тыс. кв. м, земельный участок под гараж площадью 462 кв. м, два жилых дома площадью 180 кв. м и 1,4 тыс. кв. м, квартира площадью 150 кв. м и нежилое здание площадью 199,4 кв. м.
Владимиру Пехтину принадлежат два легковых автомобиля (Porsche Cayenne и Toyota Land Сruizer), два автоприцепа, гидроцикл и снегоход «Буран», его супруге — три легковых автомобиля («Мерседес Бенц» ML350, «Мерседес Бенц» S500, «Мерседес Бенц Виано»).