В июле 2002 года Дмитрий Шохин возглавил гособвинение по делу экс-президента компании СИБУР Якова Голдовского и его заместителя Евгения Кошица, нанесших ущерб "Газпрому" и СИБУРу на 6 млрд руб. Он потребовал для Голдовского 4 года условно, а для Кошица — 3,5 года условно. 25 сентября 2002 года Гагаринский суд Москвы дал каждому по 7 месяцев реального срока и освободил от наказания в связи с отбытием его в СИЗО.
В апреле 2003 года Дмитрий Шохин выступил гособвинителем на повторном процессе по делу следователя следственного комитета при МВД РФ Павла Зайцева, обвиненного в превышении полномочий при расследовании дел "Трех китов" и "Гранда". В июле народные заседатели взяли самоотвод, объяснив его давлением со стороны прокурора. 26 августа суд возобновился: судью Ольгу Кудешкину заменил Сергей Марков, Дмитрия Шохина — Камиль Кашаев. В декабре 2003 года, уже после приговора Зайцеву, в давлении со стороны прокурора Шохина призналась судья Кудешкина.
С 14 января 2004 года Дмитрий Шохин представлял Генпрокуратуру на суде над экс-главой компании "ЮКОС-Москва" Василием Шахновским, которого обвиняли в неуплате налогов и подделке документов. Прокурор требовал отправить его в колонию на полтора года. 5 февраля 2004 года суд признал Шахновского виновным, но освободил от наказания "в связи с изменением обстановки".
С февраля 2004 года господин Шохин выступал обвинителем по делу об убийстве депутата Госдумы, лидера партии "Либеральная Россия" Сергея Юшенкова. Для заказчика, сопредседателя "Либеральной России" Михаила Коданева, и исполнителя Александра Кулачинского он требовал пожизненного заключения. Мосгорсуд приговорил обоих к 20 годам.
С мая 2004 года господин Шохин возглавил обвинение против экс-руководителей НК ЮКОС Михаила Ходорковского и Платона Лебедева, которых подозревали в хищениях и неуплате налогов. 29 марта 2005 года он потребовал приговорить обоих к 10 годам. 31 мая суд дал им по 9 лет, позже Мосгорсуд снизил сроки до 8 лет. В ходе процесса, 31 декабря 2004 года, Дмитрий Шохин президентским указом награжден орденом Почета "за заслуги в укреплении законности и правопорядка".
В декабре 2005 года Дмитрий Шохин возглавил в Мосгорсуде обвинение по делу об убийстве 9 июля 2004 года главного редактора русской версии журнала Forbes Пола Хлебникова. 5 мая 2006 года присяжные оправдали подсудимых Фаиля Садретдинова, Казбека Дукузова и Мусу Вахаева.
Процессы Камиля Кашаева
С 23 августа 2002 года Камиль Кашаев представлял обвинение в Мосгорсуде на повторном процессе по делу о взрыве на Котляковском кладбище. Вынесенный в январе 2000 года Московским окружным военным судом оправдательный приговор был в декабре отменен Верховным судом. Господин Кашаев требовал приговорить обвиняемого Михаила Смурова к 11 годам колонии строгого режима, суд 28 мая 2003 года дал ему 14 лет общего режима.
С 26 августа 2003 года господин Кашаев был обвинителем на третьем слушании в Мосгорсуде дела следователя по особо важным делам следственного комитета при МВД РФ Павла Зайцева, обвиненного в превышении полномочий при расследовании дела "Трех китов" и "Гранда". В сентябре 2002 года Мосгорсуд оправдал Павла Зайцева, но приговор был отменен, второе рассмотрение сорвалось после самоотвода народных заседателей. Сменив Дмитрия Шохина, господин Кашаев отказался от ряда пунктов обвинения и потребовал дать милицейскому следователю два года лишения свободы условно. 3 ноября 2003 года Павел Зайцев получил именно этот срок.
С 21 февраля 2005 года Камиль Кашаев выступал обвинителем в Домодедовском суде Московской области в деле билетного спекулянта Армена Арутюняна и сотрудника авиакомпании "Сибирь" Николая Коренкова. Их обвинили в "коммерческом подкупе", приведшем к подрыву чеченскими террористками двух пассажирских самолетов в августе 2004 года. 15 апреля 2005 года суд приговорил каждого обвиняемого к полутора годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии-поселении.
С 14 января 2005 года Камиль Кашаев представлял Генпрокуратуру на процессе по делу сотрудника службы безопасности НК ЮКОС Алексея Пичугина, обвиненного в убийствах и организации покушений. Обвинение требовало пожизненного заключения, однако 30 марта 2005 года Мосгорсуд приговорил господина Пичугина к 20 годам. На втором процессе над сотрудником ЮКОСа Камиль Кашаев вновь потребовал для него пожизненного заключения. 17 августа 2006 года суд лишь добавил к приговору 4 года колонии строгого режима.