Первым председателем ЦИК РФ 25 декабря 1991 года стал Василий Казаков, до того занимавший пост главы ЦИК РСФСР. Отставку господина Казакова в сентябре 1993 года связывали с итогами апрельского референдума, не позволившими президенту распустить Верховный совет. После отставки вышел на пенсию, скончался 14 октября 2008 года.
Экс-зампред Верховного совета РФ Николай Рябов вступил в должность главы ЦИКа 24 сентября 1993 года. Под его руководством в 1993 и 1995 годах состоялись выборы в Госдуму, а 12 декабря 1993 года прошел референдум, на котором была принята Конституция РФ. Летом 1996 года состоялись успешные для Кремля выборы президента. После отставки перешел на дипломатическую службу: работал послом в Чехии, Азербайджане и Молдавии. С 27 июня 2007 года — на пенсии.
Экс-зампред ЦИКа Александр Иванченко возглавил комиссию 14 ноября 1996 года. В марте 1999 года его не выдвинули в новый состав ЦИКа. Источники в Кремле сообщали, что господин Иванченко "не смог наладить отношений" с региональными избиркомами. После отставки перешел на работу в НПО "Независимый институт выборов". С 8 августа 2007 года руководит Центром обучения избирательным технологиям, созданным при ЦИКе.
Александр Вешняков занимал пост председателя два срока подряд — с 24 марта 1999 года по 26 марта 2007 года. Под его руководством проведены четыре успешные для Кремля федеральные кампании — по выборам президента (в 2000 и 2004 годах) и по выборам в парламент (в 1999 и 2003 годах). Эксперты связывали отставку господина Вешнякова с критикой инициатив "Единой России", в частности об отмене голосования "против всех". С 12 февраля 2008 года — посол России в Латвии.
Владимир Чуров занимает пост главы ЦИКа с 27 марта 2007 года. До этого был депутатом Госдумы от ЛДПР, от этой партии был делегирован в состав ЦИКа. 28 марта 2011 года переизбрался председателем на второй срок, в состав ЦИКа назначен указом президента. Провел две кампании по выборам президента РФ, а также успешные для "Единой России" выборы в Госдуму пятого и шестого созывов. Полномочия господина Чурова на посту главы ЦИКа истекают 27 марта 2016 года.