18 июля 2010 года на железнодорожной станции Ульяновск-Центральный произошло "аварийное соприкосновение" двух товарных составов, один из которых перевозил на Байконур ракету-носитель "Протон-М". Серьезное повреждение получил бак окислителя первой ступени ракеты. Три спутника "Глонасс-М" были запущены с резервного "Протона-М".
В октябре 2010 года при транспортировке на Байконур космического корабля "Союз ТМА-20" произошло его падение внутри вагона-контейнера в результате обрыва одного из крепежных элементов. Результатом стали смещение теплозащитного экрана и повреждение кожуха двигательной установки. "Союз" был возвращен на завод для замены спускаемого аппарата, который был взят у следующего корабля "Союз ТМА-21".
26 ноября 2012 года при транспортировке на Байконур по железной дороге механические повреждения двух боковых блоков ускорителя первой ступени получила ракета-носитель "Протон-М", предназначавшаяся для запуска спутников "Ямал-402" и Satmex-8. Ракета была возвращена на завод-изготовитель, а вместо нее прислана запасная.