Создано в ходе административной реформы 9 марта 2004 года, получило функции упраздненных Министерства образования, Агентства по патентам и товарным знакам, а также часть функций Министерства промышленности, науки и технологий. Курирует все уровни образования, воспитание и социальную защиту детей, профилактику безнадзорности и правонарушений несовершеннолетних, защиту интеллектуальной собственности, научную, научно-техническую и инновационную деятельность. В структуре ведомства 17 департаментов, предельная численность центрального аппарата составляет 850 человек. В ведении министерства находятся Федеральное агентство по делам молодежи (Росмолодежь) и Федеральная служба по надзору в сфере образования и науки (Рособрнадзор). Под контролем министерства — более 102 тыс. учебных заведений, в которых обучается около 30 млн человек. В 2013 году Минобрнауки освоило 391,8 млрд руб. бюджетных средств. Запланированные расходы федерального бюджета на 2014 год — 373,5 млрд руб.