Отношения Приднестровья с Россией начали портиться в 2007 году, когда Москва уладила разногласия с Кишиневом и задалась целью урегулировать приднестровский конфликт. Глава ПМР Игорь Смирнов начал противиться инициативам Кремля, выступая против любой формы воссоединения с Молдавией.
С начала 2007 года Россия заморозила финансовую помощь непризнанной республике. В ответ в июле власти ПМР внесли поправки к бюджету, остановив выплату газовых долгов России, общая сумма которых достигала $1,3 млрд, и направив собранные для расчетов с "Газпромом" деньги на свои нужды.
В феврале 2008 года лидер ПМР заявил о необходимости признания независимости республики по примеру Косово. В марте Госдума заявила, что Приднестровье — это отдельный случай и Россия видит его частью Молдавии с особым статусом.
В июле 2009 года Москва поддержала попытку неподконтрольного Игорю Смирнову парламента во главе c лидером партии "Обновление" Евгением Шевчуком урезать президентские полномочия. В ответ глава ПМР попытался добиться внесения поправок к конституции, которые позволяли бы ему переизбираться на свой пост неограниченное число раз.
В июле 2010 года Москва вновь заморозила финансовую помощь ПМР, выявив нецелевое использование средств, предназначавшихся для выплат пенсионерам. Сообщалось, что в махинациях с этими деньгами замешан приднестровский Газпромбанк, контролируемый сыном президента Смирнова.
В апреле 2011 года источники в Кремле сообщили, что в ходе визита Игоря Смирнова в Москву ему рекомендовали не выдвигать свою кандидатуру на предстоящих президентских выборах. В июне побывавшие в республике депутаты Госдумы призвали приднестровцев поддержать на выборах спикера местного парламента Анатолия Каминского.
В августе следственный комитет РФ заявил о начале проверки данных о нецелевом расходовании российской финансовой помощи в республике, в результате которой может быть заведено дело на сына и невестку главы ПМР. В сентябре Москва заявила о прекращении предоставления гражданства РФ в Приднестровье, а желающие его оформить отныне должны ездить в Кишинев. В октябре Роспотребнадзор заявил, что планирует запретить ввоз приднестровского коньяка KVINT.